Programmation d'assemblage de génomes et fondamentaux de la bioinformatique

La biologie moderne génère d'énormes quantités de données qui nécessitent des outils computationnels sophistiqués pour être interprétées. Ce cours vous initie au monde de la bioinformatique en se concentrant sur l'assemblage de génomes – le processus d'assemblage de millions de fragments d'ADN en une seule séquence. Vous passerez de la compréhension des bases biologiques à la mise en œuvre des algorithmes qui aident les scientifiques à identifier des agents pathogènes inconnus et à étudier le code génétique. En lisant des explications détaillées et en appliquant la logique à des scénarios de programmation, vous construirez une base solide sur la façon dont les logiciels pilotent la découverte biologique. Ce que vous apprendrez : * Comprendre les principes biologiques et computationnels fondamentaux de l'assemblage de génomes * Appliquer des concepts de théorie des graphes tels que les chemins de De Bruijn à la reconstruction de séquences * Pratiquer l'analyse des k-mers pour traiter efficacement les données génétiques fragmentées * Mettre en œuvre des algorithmes fondamentaux de type overlap-layout-consensus pour le mappage de l'ADN * Apprendre les modèles de programmation modernes pour la bioinformatique, y compris les structures de données type-safe * Analyser la logique derrière la résolution de mystères d'épidémies bactériennes du monde réel grâce au code Le cours commence par la terminologie essentielle et l'histoire du séquençage avant de passer aux défis algorithmiques utilisés par les chercheurs modernes. Ce programme textuel est conçu pour les débutants ayant un intérêt de base pour la programmation et la biologie ; aucune expérience préalable en bioinformatique n'est requise. Commencez dès aujourd'hui votre voyage à l'intersection du code et des sciences de la vie.