Podstawy analizy danych NGS: odświeżacz bioinformatyki

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) zrewolucjonizowało biologię i medycynę, ale nurkowanie w surowych danych genomicznych może być przytłaczające bez silnego zrozumienia podstaw.Ten kurs tekstowy ma na celu wypełnienie tej luki, pomagając w budowaniu lub odświeżaniu podstawowej wiedzy na temat technologii NGS i przepływów danych. Będziesz przechodzić od zrozumienia podstawowej chemii sekwencjonowania do pewnego poruszania się po standardowych krokach rurociągów bioinformatycznych.Skupiając się na koncepcyjnych i teoretycznych podstawach danych genomowych, przygotujecie się do praktycznych analiz, projektów badawczych lub zaawansowanych badań technicznych. Co się nauczysz: Zrozumienie podstawowej chemii i mechaniki różnych wysokowydajnych platform NGS;Identyfikuj i interpretuj standardowe formaty plików genomowych, w tym FASTQ, SAM, BAM i VCF;Oceń jakość sekwencji za pomocą kluczowych wskaźników, takich jak wyniki jakości Phred i wskaźniki zanieczyszczenia adaptera;Nauka zasad sekwencyjnego Kurs rozpoczyna się od kluczowej terminologii i biologicznych podstaw sekwencjonowania, a następnie przechodzi do formatów danych, kontroli jakości i metodologii wyrównywania.Następnie uczestnicy będą mieli możliwość zapoznania się z podstawowymi technikami sekwencje, takimi jak sekwencjonowanie, wyrównywanie, mapowanie odczytów do genomu referencyjnego i wywoływanie wariantów; Wzmocnisz swoją naukę poprzez pisemne wyjaśnienia, przewodniki koncepcyjne i ćwiczenia samooceny.Ten kurs jest przeznaczony dla początkujących w bioinformatyce, studentów nauk przyrodniczych i badaczy, którzy chcą odświeżyć swoją wiedzę teoretyczną na temat NGS przed rozpoczęciem praktycznej analizy danych. Zacznij czytać już dziś, aby odblokować podstawy analizy danych genomowych.