Analyse Génomique Bactérienne avec BV-BRC

La génomique bactérienne transforme la médecine, l'agriculture et la biotechnologie, mais l'analyse des données de séquençage peut sembler décourageante sans les bons outils. Ce cours vous initie aux bases de la bioinformatique bactérienne en utilisant la puissante plateforme BV-BRC, basée sur le web. Vous passerez de la compréhension des concepts génomiques de base à l'exécution confiante de flux de travail d'analyse standard. En étudiant des explications écrites et en travaillant sur des guides pratiques basés sur du texte, vous apprendrez à traiter les lectures de séquençage brutes, à assembler les génomes, à annoter les gènes et à comparer les souches bactériennes. Ce que vous apprendrez : - Comprendre les concepts fondamentaux de la génomique bactérienne et les formats de données de séquençage. - Effectuer le contrôle qualité des lectures de séquençage brutes pour garantir l'intégrité des données. - Assembler des génomes bactériens à partir de lectures brutes en utilisant des flux de travail taxonomiques modernes. - Annoter les caractéristiques génomiques pour identifier les gènes codant des protéines et les voies métaboliques. - Comparer plusieurs génomes bactériens pour identifier les différences taxonomiques et les relations évolutives. - Naviguer dans l'interface BV-BRC pour gérer des espaces de travail privés et exécuter des outils d'analyse. Le cours commence par la terminologie essentielle et les structures de données génomiques avant de vous guider étape par étape à travers les flux de travail d'assemblage, d'annotation et d'analyse comparative. Il est conçu pour les débutants en bioinformatique, les étudiants en microbiologie et les chercheurs souhaitant commencer à analyser des données de séquençage bactérien sans avoir besoin d'une expérience préalable en programmation. Commencez à lire dès aujourd'hui pour découvrir les informations cachées dans les génomes bactériens.