Создание конвейера клинической обработки естественного языка: заметки, сущности и надежные результаты

Создание конвейера клинической обработки естественного языка (NLP), который выдерживает медицинскую проверку, требует тщательного проектирования на каждом этапе. Данные, которые вы собираете, аннотации, которым вы доверяете, модели, которые вы выбираете, и то, как вы справляетесь с неопределенностью, — все это определяет, станет ли конвейер надежным участником или тихим источником ошибок. Этот курс рассматривает эти решения в том порядке, в котором они возникают. Вы выполните письменные упражнения по проектированию, которые отражают то, как команда клинической информатики планировала бы конвейер NLP. Акцент делается на практических компромиссах, которые имеют значение, когда цена ошибки необычайно высока. Что вы узнаете: - Планирование сбора данных из заметок, отчетов и исследовательских статей с учетом конфиденциальности и согласия - Проектирование процедур аннотирования, которые дают надежную истинную основу, включая межитераторное согласие - Применение основных методов NLP, включая распознавание именованных сущностей, извлечение отношений и классификацию - Сопоставление извлеченных сущностей с клиническими онтологиями, такими как SNOMED CT, RxNorm и UMLS - Количественная оценка неопределенности, чтобы последующие системы могли принимать обоснованные решения об неоднозначных результатах - Планирование процедур валидации, включая оценку на отложенных данных, проспективное тестирование и обзор клиницистами Курс проходит от данных и аннотирования через моделирование, сопоставление с онтологиями, неопределенность и валидацию. Итоговое письменное упражнение предлагает вам составить одностраничный проект конвейера клинической NLP, ориентированного на конкретный клинический или исследовательский вариант использования. Этот курс предназначен для специалистов по данным в области здравоохранения, студентов медицинских информационных систем и специалистов по NLP, работающих в сфере здравоохранения. Глубокие клинические знания не требуются. Курс рассматривает конвейер как проблему проектирования и остается информационным; он не предоставляет клинических рекомендаций для конкретных ситуаций с пациентами.