Podstawy biologii algorytmicznej i genomiki obliczeniowej

Biologia obliczeniowa opiera się na wydajnych algorytmach pozwalających odczytywać złożone dane genomiczne i rozwiązywać współczesne wyzwania biologiczne. Ten kurs tekstowy przeprowadzi Cię przez fundamentalne pojęcia, terminologię i zasady algorytmiczne niezbędne do analizy sekwencji oraz struktur biologicznych. Odkryjesz punkt styku informatyki i biologii, ucząc się, jak podstawowe paradygmaty algorytmiczne odpowiadają na rzeczywiste problemy genomiczne. Materiał dydaktyczny rozpoczyna się od jasnych definicji kluczowych terminów, a następnie przechodzi do praktycznych strategii rozwiązywania problemów i modeli obliczeniowych. Czego się nauczysz: - Zrozumiesz podstawową terminologię biologiczną i struktury danych stosowane w bioinformatyce - Zastosujesz techniki programowania dynamicznego do dopasowywania sekwencji (parami i wielokrotnego) - Poznasz algorytmy grafowe wykorzystywane w składaniu genomu de novo i rekonstrukcji fragmentów - Przeanalizujesz algorytmy tworzenia drzew filogenetycznych i modelowania ewolucyjnego - Zbadasz nowoczesne podejścia obliczeniowe do danych z sekwencjonowania wysokoprzepustowego - Przećwiczysz formułowanie pytań biologicznych jako ustrukturyzowanych problemów algorytmicznych Kurs rozpoczyna się od podstawowych definicji biologicznych i podstaw operacji na łańcuchach znaków, przechodzi przez standardowe algorytmy dopasowywania i składania sekwencji, a kończy się omówieniem otwartych problemów obliczeniowych we współczesnej genomice. Ten kurs jest przeznaczony dla osób początkujących zainteresowanych bioinformatyką, studentów informatyki oraz samouków szukających przystępnego, pisanego wprowadzenia do biologii algorytmicznej. Wcześniejsze doświadczenie w genomice obliczeniowej nie jest wymagane. Zacznij czytać, aby zbudować solidne podstawy w dziedzinie algorytmów kształtujących współczesne badania biologiczne.