مقدمة في المعلوماتية الحيوية: تجميع وتحديد جينومات الفيروسات

عند ظهور فيروس جديد، فإن الخطوة الأولى لمكافحته هي فك شفرة مخططه الجيني. توفر المعلوماتية الحيوية الأدوات الحاسوبية الأساسية لتحويل بيانات التسلسل الخام إلى جينوم فيروسي كامل وقابل للتحديد. في هذه الدورة النصية، ستتعلم المفاهيم الأساسية لعلم الأحياء الحاسوبي وتتبع العملية خطوة بخطوة المستخدمة لتجميع وتحديد مسببات الأمراض الفيروسية، مثل SARS-CoV-2. ستفهم كيف يفك العلماء تسلسلات الجينات، ويجرون مراقبة الجودة على البيانات الجينومية، ويستخدمون خوارزميات المحاذاة لإعادة بناء الشفرة الجينية للفيروس. ما ستتعلمه: - فهم المبادئ الأساسية لعلم الجينوم، وتسلسل الحمض النووي، وتكاثر الفيروسات. - تعلم كيفية تحليل وتحليل تنسيقات البيانات الجينومية مثل FASTA و FASTQ. - تطبيق خوارزميات محاذاة التسلسل وتجميع الجينوم لإعادة بناء جينومات الفيروسات. - استكشاف قواعد البيانات البيولوجية العامة لاسترداد ومقارنة بيانات التسلسل المرجعي. - تحديد الطفرات الجينية والاختلافات في جينومات مسببات الأمراض باستخدام الأدوات الحاسوبية. - التدرب على كتابة نصوص Python أساسية لأتمتة تحليل تسلسل الحمض النووي. يبدأ هذا الدليل المكتوب بالمصطلحات الجينومية الأساسية قبل الانتقال إلى معالجة البيانات العملية ومحاذاة التسلسل والتحليل المقارن. ستقرأ تفسيرات واضحة وتدرس أمثلة برمجية توضح كيف تصبح البيانات البيولوجية الخام رؤى علمية قابلة للتنفيذ. تم تصميم هذه الدورة للمبتدئين المهتمين بعلم الأحياء الحاسوبي أو التكنولوجيا الحيوية أو البرمجة. لا يلزم وجود خلفية مسبقة في المعلوماتية الحيوية أو علم الأحياء المتقدم. ابدأ رحلتك في علم الأحياء الحاسوبي وتعلم كيفية فك شفرة جينومات مسببات الأمراض الفيروسية اليوم.