Введение в биоинформатику: сборка и идентификация вирусных геномов

Когда появляется новый вирус, первым шагом в борьбе с ним является расшифровка его генетической копии. Биоинформатика предоставляет необходимые вычислительные инструменты для преобразования необработанных данных секвенирования в полный, идентифицируемый вирусный геном. В этом текстовом курсе вы узнаете основные понятия вычислительной биологии и пройдете пошаговый процесс, используемый для сборки и идентификации вирусных патогенов, таких как SARS-CoV-2. Вы узнаете, как ученые расшифровывают генетические последовательности, осуществляют контроль качества геномных данных и используют алгоритмы выравнивания для реконструкции генетического кода вируса. Что вы узнаете: - Понять основные принципы геномики, секвенирования ДНК и репликации вирусов. - Узнайте, как анализировать и анализировать форматы геномных данных, такие как FASTA и FASTQ. - Применять алгоритмы выравнивания последовательностей и сборки генома для реконструкции вирусных геномов. - изучение открытых биологических баз данных для извлечения и сопоставления данных о эталонных последовательностях. - идентификация генетических мутаций и вариаций в геноме патогена с использованием вычислительных средств. - Практика написания основных скриптов Python для автоматизации анализа последовательностей ДНК. Это письменное руководство начинается с фундаментальной терминологии генома, прежде чем перейти к практическому манипулированию данными, выравниванию последовательностей и сравнительному анализу. Вы прочтете четкие объяснения и изучите примеры кода, которые демонстрируют, как необработанные биологические данные становятся практическими научными знаниями. Этот курс предназначен для начинающих, заинтересованных в вычислительной биологии, биотехнологии или программировании. Не требуется предварительного опыта в биоинформатике или продвинутой биологии. Начните свое путешествие в вычислительной биологии и узнать, как расшифровать геномы вирусных патогенов сегодня.