Fondamenti e Bioinformatica di Sequenziamento di Terza Generazione di Nanopore

Il sequenziamento di terza generazione ha trasformato la genomica consentendo l'analisi diretta e in tempo reale di lunghi frammenti di DNA e RNA. Questo corso scritto fornisce una base completa nella tecnologia, guidandoti dalla meccanica biologica fondamentale alle pipeline di bioinformatica a riga di comando. Cosa imparerai: - Comprendere i principi fondamentali del rilevamento dei nanopore e del sequenziamento dei filamenti biologici - Esplora le piattaforme hardware disponibili, le architetture delle celle di flusso e i protocolli di preparazione delle librerie - Padroneggiare i moderni modelli di basecalling e i concetti di elaborazione del segnale grezzo per letture ad alta precisione - Analizza i dataset di lettura lunga per l'assemblaggio del genoma, l'allineamento di letura e la chiamata di variante - Applicare il controllo qualità, il filtraggio di lettura e le strategie di campionamento adattivo all'analisi a valle - Pratica i flussi di lavoro di bioinformatica utilizzando il software standard a riga di comando per i dati a lunga lettura Il corso inizia con concetti fondamentali, terminologia chiave e principi fisici prima di passare attraverso le fasi pratiche di elaborazione bioinformatica e valutazione dei dati.Progettato specificamente per i principianti, ricercatori e studenti di biologia o informatica, questa guida basata su testo non richiede alcuna esperienza precedente con gli strumenti di sequenziamento. Inizia a leggere oggi per costruire competenze pratiche in genomica a lunga lettura.