Bioinformatica Vegetale: Analisi Pratica del Genoma e del Trascrittoma

La rapida espansione dei dati genomici ha trasformato la biologia vegetale in un campo basato sui dati, dove le intuizioni biologiche vengono scoperte attraverso l'analisi computazionale. Questo corso fornisce un percorso chiaro per comprendere come elaborare e interpretare le vaste quantità di informazioni generate dalle moderne tecnologie di sequenziamento. Passerete dall'apprendimento dei formati di dati biologici di base all'esecuzione di analisi sofisticate di genomi e trascrittomi vegetali.\n\nAttraverso spiegazioni scritte ed esempi pratici, svilupperete le competenze necessarie per navigare nel complesso panorama dei database e degli strumenti di analisi specifici per le piante. Al termine di questo corso, sarete in grado di tradurre i dati di sequenza grezzi in significative ipotesi biologiche riguardanti la crescita delle piante, la risposta allo stress e la regolazione molecolare.\n\nCosa imparerai:\n- Comprendere la struttura fondamentale dei genomi vegetali e i formati dei dati di sequenziamento\n- Analizzare i set di dati RNA-seq per profilare i modelli di espressione genica attraverso i tessuti vegetali\n- Esplorare le interazioni proteina-proteina e proteina-DNA utilizzando set di dati ad alto rendimento\n- Applicare i moderni principi di gestione dei dati per una ricerca vegetale riproducibile\n- Esercitarsi a interrogare ed estrarre informazioni dai principali repository di bioinformatica vegetale\n- Imparare a identificare motivi regolatori e funzioni geniche all'interno delle sequenze genomiche vegetali\n\nIl corso inizia con un'introduzione alla terminologia chiave e ai concetti fondamentali della biologia molecolare vegetale, prima di passare a flussi di lavoro specifici per l'analisi dei dati genomici e trascrittomici. Questo approccio garantisce la costruzione di una solida base teorica prima di applicare le proprie conoscenze a scenari di ricerca pratici.\n\nQuesto corso è progettato per principianti in biologia, agricoltura o data science che desiderano specializzarsi nella ricerca vegetale. Non è richiesta alcuna esperienza precedente con la bioinformatica o la programmazione per iniziare.