Bioinformatyka roślin: praktyczna analiza genomu i transkriptomu

Szybka ekspansja danych genomowych przekształciła biologię roślin w dziedzinę opartą na danych, w której odkrywa się wiedzę biologiczną poprzez analizę obliczeniową.Kurs ten zapewnia jasną ścieżkę do zrozumienia, jak przetwarzać i interpretować ogromne ilości informacji generowanych przez nowoczesne technologie sekwencjonowania. Przejdziesz od nauki podstawowych formatów danych biologicznych do wykonywania zaawansowanych analiz genomów roślin i transkriptomów. Poprzez pisemne wyjaśnienia i praktyczne przykłady rozwiniesz umiejętności potrzebne do poruszania się po złożonym krajobrazie baz danych i narzędzi analitycznych specyficznych dla roślin.Pod koniec tego kursu będziesz w stanie przetłumaczyć surowe dane sekwencyjne na sensowne hipotezy biologiczne dotyczące wzrostu roślin, reakcji na stres i regulacji molekularnej. Czego się nauczysz: - Zrozum podstawową strukturę genomów roślin i formatów danych sekwencjonowania - Analizuj zestawy danych RNA-seq, aby profilować wzorce ekspresji genów w tkankach roślinnych - Poznaj interakcje białko-białko i białkowo-DNA przy użyciu zestawów danych o wysokiej przepustowości - Zastosuj nowoczesne zasady zarządzania danymi do powtarzalnych badań roślin - Ćwicz zapytania i wyodrębnianie informacji z głównych repozytoriów bioinformatyki roślinnej - Naucz się identyfikować motywy regulacyjne i funkcje genów w sekwencjach genomowych roślin Kurs rozpoczyna się od wprowadzenia do kluczowej terminologii i podstawowych pojęć w biologii molekularnej roślin, zanim przejdziemy do konkretnych przepływów pracy w zakresie analizy danych genomicznych i transkrytomicznych.Podejście to zapewnia zbudowanie solidnej podstawy teoretycznej przed zastosowaniem wiedzy do praktycznych scenariuszy badawczych. Ten kurs jest przeznaczony dla początkujących w dziedzinie biologii, rolnictwa lub nauki o danych, którzy chcą specjalizować się w badaniach roślin.Do rozpoczęcia nie jest wymagane wcześniejsze doświadczenie w bioinformatyce lub programowaniu.