Podstawy sekwencjonowania nowej generacji i przetwarzanie danych

Sekwencjonowanie o wysokiej przepustowości zrewolucjonizowało nowoczesną genomikę i badania biologiczne, tworząc ogromne zapotrzebowanie na umiejętności w zakresie przetwarzania surowych danych sekwencjonujących.Ten pisemny kurs stanowi uporządkowane wprowadzenie do technologii sekwencje nowej generacji (NGS), przenosząc Cię od podstawowych pojęć do analizy danych pierwotnych. Zaczniesz od opanowania podstawowej terminologii, platform sekwencjonowania i podstaw projektowania eksperymentalnego przed zagłębieniem się w ocenę danych.Dzięki szczegółowym pisemnym wyjaśnieniom i przykładom z przewodnikiem nauczysz się oceniać jakość sekwencje, obsługiwać standardowe formaty bioinformatyczne i wykonywać podstawowe potoki przetwarzania danych. Co się nauczysz: Zrozumienie kluczowych platform NGS, aplikacji i podstawowej terminologii genomicznej.Wykonaj kontrolę jakości surowych danych w celu zidentyfikowania artefaktów sekwencjonowania i zanieczyszczeń.Nawiguj i konwertuj standardowe formaty plików genomicznych, takie jak FASTQ, SAM, BAM i VCF. Zastosuj strategie filtrowania, przycinania i przetwarzania wstępnego do analizy w dół.Zapoznaj się z przepływami pracy wyrównania i nowoczesnymi koncepcjami powtarzalnych rurociągów w bioinformatyce. Kurs zaczyna się od jasnych definicji podstawowych koncepcji molekularnych i obliczeniowych, a następnie logicznie przechodzi do praktycznych technik manipulacji danymi. Zaprojektowany specjalnie dla początkujących w bioinformatyce, badaczy i studentów biologii, nie jest wymagane wcześniejsze doświadczenie obliczeniowe.Zacznij czytać już dziś, aby zbudować silne podstawy w analizie sekwencjonowania o wysokiej przepustowości.