พื้นฐาน Next-Generation Sequencing และการประมวลผลข้อมูล

การถอดรหัสพันธุกรรมแบบใช้กำลังส่งสูง (High-throughput sequencing) ได้ปฏิวัติวงการจีโนมิกส์และการวิจัยทางชีววิทยาสมัยใหม่ ทำให้เกิดความต้องการอย่างมากในทักษะการประมวลผลข้อมูลการถอดรหัสพันธุกรรมดิบ คอร์สเรียนแบบการอ่านนี้มีการแนะนำเทคโนโลยี Next-Generation Sequencing (NGS) อย่างเป็นระบบ โดยนำคุณตั้งแต่แนวคิดหลักไปจนถึงการวิเคราะห์ข้อมูลขั้นต้น คุณจะเริ่มต้นด้วยการเชี่ยวชาญคำศัพท์พื้นฐาน แพลตฟอร์มการถอดรหัสพันธุกรรม และพื้นฐานการออกแบบการทดลองก่อนที่จะดำดิ่งสู่การประเมินข้อมูล จากคำอธิบายอย่างละเอียดและตัวอย่างที่มีการแนะนำ คุณจะได้เรียนรู้วิธีการประเมินคุณภาพของการถอดรหัสพันธุกรรม การจัดการรูปแบบไฟล์ชีวสารสนเทศมาตรฐาน และการรันพายไลน์การประมวลผลข้อมูลขั้นต้น สิ่งที่คุณจะได้เรียนรู้: ทำความเข้าใจแพลตฟอร์ม NGS หลัก แอปพลิเคชัน และคำศัพท์พื้นฐานด้านจีโนมิกส์ ทำการควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบเพื่อระบุสิ่งแปลกปลอมและสารปนเปื้อนจากการถอดรหัสพันธุกรรม ใช้งานและแปลงรูปแบบไฟล์จีโนมิกส์มาตรฐาน เช่น FASTQ, SAM, BAM และ VCF ประยุกต์ใช้กลยุทธ์การกรอง การตัดแต่ง (trimming) และการเตรียมข้อมูลขั้นต้นสำหรับการวิเคราะห์ในขั้นตอนถัดไป สำรวจเวิร์กโฟลว์การจัดเรียงลำดับ (alignment) และแนวคิดพายไลน์สมัยใหม่ที่ทำซ้ำได้ในงานชีวสารสนเทศ คอร์สนี้เริ่มต้นด้วยคำนิยามที่ชัดเจนของแนวคิดหลักทางอณูชีววิทยาและวิทยาการคำนวณ จากนั้นจึงพัฒนาไปสู่เทคนิคการจัดการข้อมูลเชิงปฏิบัติอย่างเป็นระบบ ออกแบบมาโดยเฉพาะสำหรับผู้เริ่มต้นในสายงานชีวสารสนเทศ นักวิจัย และนักศึกษาชีววิทยา โดยไม่จำเป็นต้องมีพื้นฐานด้านการคำนวณมาก่อน เริ่มอ่านตั้งแต่วันนี้เพื่อสร้างพื้นฐานที่แข็งแกร่งในการวิเคราะห์การถอดรหัสพันธุกรรมแบบใช้กำลังส่งสูง