Ewolucja molekularna i filogenetyka w bioinformatyce

W jaki sposób naukowcy śledzą historię życia i odkrywają pochodzenie wirusów lub starożytnych gatunków? Odpowiedź leży w ewolucji molekularnej. Stosujemy metody obliczeniowe, aby odkodować relacje ewolucyjne ukryte w sekwencjach DNA i białek. Ten kurs przeprowadzi Cię przez podstawowe pojęcia i algorytmy używane do konstruowania drzew filogenetycznych i analizowania danych molekularnych.Będziesz przechodzić od zrozumienia podstawowych mutacji genetycznych do rekonstrukcji historii ewolucyjnych za pomocą nowoczesnych przepływów pracy w biologii obliczeniowej. Czego się nauczysz: - Zrozum podstawowe mechanizmy ewolucji molekularnej, duplikacji genów i rozbieżności sekwencji. - Zastosuj algorytmy oparte na odległości i znakach, aby skonstruować dokładne drzewa filogenetyczne. - Analizuj dane genetyczne za pomocą modeli probabilistycznych, w tym maksymalnego prawdopodobieństwa i nowoczesnych podejść do wnioskowania bayesowskiego. - Porównaj sekwencje DNA i białek za pomocą nowoczesnych narzędzi do wyrównywania i bibliotek bioinformatycznych opartych na Pythonie. - Interpretuj drzewa ewolucyjne, aby rozwiązać zagadki biologiczne, takie jak śledzenie ognisk chorób lub identyfikacja wspólnych przodków. Zaczniesz od opanowania podstawowej terminologii biologicznej i koncepcji ewolucyjnych, zanim przejdziesz do krok po kroku pisemnych wyjaśnień algorytmów budowania drzew.Poprzez uporządkowane wyjaśniania tekstowe i ćwiczenia pisemne będziesz ćwiczyć ocenę modeli ewolucyjnej i analizę danych sekwencji. Ten kurs jest przeznaczony dla początkujących w bioinformatyce, studentów biologii lub programistów, którzy chcą przejść do biologii obliczeniowej, bez wymaganej zaawansowanej wiedzy. Rozpocznij swoją podróż w historii genomów i nauczyć się odkodować przeszłość ewolucyjną dzisiaj.