Основы метагеномики: анализ микробных сообществ

Микроорганизмы формируют наш мир, но подавляющее большинство из них не могут быть выращены в лаборатории. Метагеномика открывает эти скрытые сообщества, анализируя геномный материал непосредственно из образцов окружающей среды, минуя необходимость культивирования. Этот всеобъемлющий текстовый курс поможет вам освоить основные биологические концепции микробиологии окружающей среды и современные биоинформатические рабочие процессы, используемые для профилирования видов и их функций. Вы получите прочную концептуальную и практическую основу для анализа метагеномных данных, подготовив вас к интерпретации сложных микробных экосистем. Что вы узнаете: Понимание основных принципов метагеномики и ее отличий от традиционной геномике; Изучение технологий секвенирования, включая современные концепции короткого чтения и длинного чтение секвенирование; Анализ методов таксономического профилирования для определения состава видов сообщества; Оценка рабочих процессов функциональных аннотаций для определении Практикуются в интерпретации показателей контроля качества и стратегий сборки для метагеномных наборов данных; Применяют современные концепции трубопроводов, такие как профилирование на основе чтения и сборки, к пробам окружающей среды. Программа начинается с основных биологических и экологических терминов, а затем переходит к методологиям секвенирования, предварительной обработки данных, таксономической классификации и функциональному профилированию. Предназначен для начинающих в биоинформатике, студентов биологических наук и исследователей, ищущих ясное, структурированное введение в метагеномику без предварительного опыта программирования. Начните читать сегодня, чтобы раскрыть геномные секреты микробного мира.