Podstawy metagenomiki: Analiza społeczności mikrobiologicznych

Mikroorganizmy kształtują nasz świat, ale zdecydowana większość nie może być uprawiana w laboratorium.Metagenomika odblokowuje te ukryte społeczności, analizując materiał genomowy bezpośrednio z próbek środowiskowych, omijając potrzebę uprawy. Ten kompleksowy kurs tekstowy prowadzi od podstawowych pojęć biologicznych mikrobiologii środowiska do nowoczesnych procesów bioinformatycznych wykorzystywanych do profilowania gatunków i ich funkcji.Zdobędziesz solidne podstawy koncepcyjne i praktyczne w analizie danych metagenomicznych, przygotowując Cię do interpretowania złożonych ekosystemów mikrobiologicznych. Czego się nauczysz: Zrozum podstawowe zasady metagenomiki i jak różni się ona od tradycyjnej genomiki; Poznaj technologie sekwencjonowania, w tym nowoczesne koncepcje sekwencje krótko-czytane i długo-czytanie; Analizuj metody profilowania taksonomicznego w celu identyfikacji składu gatunkowego społeczności; Ocenić przepływy pracy adnotacji funkcjonalnej w celu określenia Praktyka interpretowania wskaźników kontroli jakości i strategii montażu dla zbiorów danych metagenomicznych; Zastosuj nowoczesne koncepcje rurociągów, takie jak profilowanie oparte na odczycie i montażu, do próbek środowiskowych. Program nauczania rozpoczyna się od podstawowej terminologii biologicznej i ekologicznej przed przejściem do metodyk sekwencjonowania, wstępnego przetwarzania danych, binowania taksonomicznego i profilowania funkcjonalnego. Zaprojektowany dla początkujących w bioinformatyce, studentów nauk przyrodniczych i badaczy poszukujących jasnego, uporządkowanego wprowadzenia do metagenomiki bez konieczności wcześniejszego doświadczenia w programowaniu.Zacznij czytać już dziś, aby odblokować genomiczne tajemnice świata mikroorganizmów.