Grundlagen der Metagenomik: Analyse mikrobieller Gemeinschaften

Mikroorganismen prägen unsere Welt. Die große Mehrheit kann jedoch nicht im Labor gezüchtet werden. Metagenomics erschließt diese verborgenen Gemeinschaften, indem genomisches Material direkt aus Umweltproben analysiert wird, ohne dass eine Kultivierung erforderlich ist. Dieser umfassende textbasierte Kurs führt Sie von den grundlegenden biologischen Konzepten der Umweltmikrobiologie zu den modernen bioinformatischen Arbeitsabläufen, die zum Profilieren von Arten und deren Funktionen verwendet werden.Sie erhalten eine solide konzeptionelle und praktische Grundlage für die Analyse von metagenomischen Daten und bereiten Sie auf die Interpretation komplexer mikrobieller Ökosysteme vor. Was Sie lernen werden: Verstehen Sie die Grundprinzipien der Metagenomik und wie sie sich von der traditionellen Genomik unterscheiden; Erkunden Sie Sequenzierungstechnologien, einschließlich moderner Short-Read- und Long-Read Sequencierungskonzepte; Analysieren Sie taxonomische Profilierungsmethoden, um die Artenzusammensetzung einer Gemeinschaft zu identifizieren; Bewerten Sie funktionale Annotations-Workflows, um zu bestimmen, ob eine Art in einer G Die Studierenden werden die Grundlagen der Bioinformatik erlernen und das metabolische Potenzial des Ökosystems erforschen. Sie werden die Interpretation von Qualitätskontrollmetriken und Montagestrategien für metagenomische Datensätze üben. Der Lehrplan beginnt mit der wesentlichen biologischen und ökologischen Terminologie, bevor er in Sequenzierungsmethoden, Datenvorverarbeitung, taxonomisches Binning und funktionales Profiling übergeht. Das Buch ist für Anfänger in der Bioinformatik, Studenten der Lebenswissenschaften und Forscher gedacht, die eine klare, strukturierte Einführung in die Metagenomik suchen, ohne dass vorherige Programmierkenntnisse erforderlich sind.