メタゲノミクス基礎：微生物群集の解析

微生物は私たちの世界を形作っていますが、その大部分は実験室で培養することができません。メタゲノミクスは、環境サンプルから直接ゲノム物質を解析することで、培養の必要性を回避し、これらの隠された群集を解明します。この包括的なテキストベースのコースでは、環境微生物学の基本的な生物学的概念から、種やその機能をプロファイリングするために使用される最新のバイオインフォマティクスワークフローまでをガイドします。メタゲノムデータの解析における確かな概念的および実践的な基礎を習得し、複雑な微生物生態系を解釈する準備を整えます。学習内容：メタゲノミクスの核心原則と、従来のゲノミクスとの違いを理解する。最新のショートリードおよびロングリードシーケンシングの概念を含む、シーケンシング技術を探求する。群集の種組成を特定するための分類学的プロファイリング手法を解析する。生態系の代謝ポテンシャルを決定するための機能アノテーションワークフローを評価する。メタゲノムデータセットの品質管理指標とアセンブリ戦略の解釈を練習する。リードベースおよびアセンブリベースのプロファイリングなど、環境サンプルに対する最新のパイプライン概念を適用する。カリキュラムは、基本的な生物学的および生態学的な用語から始まり、シーケンシング手法、データ前処理、タクソノミックビニング、機能プロファイリングへと移行します。バイオインフォマティクスの初心者、生命科学の学生、およびプログラミング経験を必要とせず、メタゲノミクスへの明確で構造化された入門を求める研究者向けに設計されています。微生物世界のゲノムの秘密を解き明かすために、今すぐ読み始めましょう。